Для определения рода слова “вагранка” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “вагранка” . Тогда в зависимости от окончания в слове “вагранка” можно определить род.
Слово “вагранка” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “вагранка” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “вагранка” находится по ссылке