Для определения рода слова “маргарит” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “маргарит” . Тогда в зависимости от окончания в слове “маргарит” можно определить род.
Слово “маргарит” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “маргарит” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “маргарит” находится по ссылке