Для определения рода слова “ниточка” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “ниточка” . Тогда в зависимости от окончания в слове “ниточка” можно определить род.
Слово “ниточка” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “ниточка” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “ниточка” находится по ссылке