Для определения рода слова “подсистема” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “подсистема” . Тогда в зависимости от окончания в слове “подсистема” можно определить род.
Слово “подсистема” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “подсистема” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “подсистема” находится по ссылке