Для определения рода слова “рационалист” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “рационалист” . Тогда в зависимости от окончания в слове “рационалист” можно определить род.
Слово “рационалист” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “рационалист” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “рационалист” находится по ссылке