Для определения рода слова “томат” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “томат” . Тогда в зависимости от окончания в слове “томат” можно определить род.
Слово “томат” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “томат” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “томат” находится по ссылке