Для определения рода слова “устье” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “устье” . Тогда в зависимости от окончания в слове “устье” можно определить род.
Слово “устье” употребляется в среднем роде (Потому как в начальной форме слова “устье” окончание [е], [о]).Полный морфологический разбор Cуществительного “устье” находится по ссылке