Для определения рода слова “бункер” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “бункер” . Тогда в зависимости от окончания в слове “бункер” можно определить род.
Слово “бункер” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “бункер” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “бункер” находится по ссылке