Для определения рода слова “водомер” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “водомер” . Тогда в зависимости от окончания в слове “водомер” можно определить род.
Слово “водомер” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “водомер” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “водомер” находится по ссылке