Для определения рода слова “жемчужница” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “жемчужница” . Тогда в зависимости от окончания в слове “жемчужница” можно определить род.
Слово “жемчужница” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “жемчужница” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “жемчужница” находится по ссылке