Для определения рода слова “злодей” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “злодей” . Тогда в зависимости от окончания в слове “злодей” можно определить род.
Слово “злодей” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “злодей” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “злодей” находится по ссылке