Для определения рода слова “лен” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “лен” . Тогда в зависимости от окончания в слове “лен” можно определить род.
Слово “лен” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “лен” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “лен” находится по ссылке