Для определения рода слова “мегаполис” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “мегаполис” . Тогда в зависимости от окончания в слове “мегаполис” можно определить род.
Слово “мегаполис” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “мегаполис” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “мегаполис” находится по ссылке