Для определения рода слова “морфонология” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “морфонология” . Тогда в зависимости от окончания в слове “морфонология” можно определить род.
Слово “морфонология” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “морфонология” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “морфонология” находится по ссылке