Для определения рода слова “наган” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “наган” . Тогда в зависимости от окончания в слове “наган” можно определить род.
Слово “наган” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “наган” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “наган” находится по ссылке