Для определения рода слова “недостаток” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “недостаток” . Тогда в зависимости от окончания в слове “недостаток” можно определить род.
Слово “недостаток” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “недостаток” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “недостаток” находится по ссылке