Для определения рода слова “патогенез” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “патогенез” . Тогда в зависимости от окончания в слове “патогенез” можно определить род.
Слово “патогенез” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “патогенез” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “патогенез” находится по ссылке