Для определения рода слова “пятно” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “пятно” . Тогда в зависимости от окончания в слове “пятно” можно определить род.
Слово “пятно” употребляется в среднем роде (Потому как в начальной форме слова “пятно” окончание [е], [о]).Полный морфологический разбор Cуществительного “пятно” находится по ссылке