Для определения рода слова “стебель” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “стебель” . Тогда в зависимости от окончания в слове “стебель” можно определить род.
Слово “стебель” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “стебель” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “стебель” находится по ссылке