Для определения рода слова “ступа” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “ступа” . Тогда в зависимости от окончания в слове “ступа” можно определить род.
Слово “ступа” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “ступа” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “ступа” находится по ссылке