Для определения рода слова “флакон” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “флакон” . Тогда в зависимости от окончания в слове “флакон” можно определить род.
Слово “флакон” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “флакон” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “флакон” находится по ссылке