Для определения рода слова “цистит” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “цистит” . Тогда в зависимости от окончания в слове “цистит” можно определить род.
Слово “цистит” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “цистит” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “цистит” находится по ссылке