Для определения рода слова “яма” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “ям” . Тогда в зависимости от окончания в слове “ям” можно определить род.
Слово “яма” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “ям” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “яма” находится по ссылке