Для определения рода слова “апатит” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “апатит” . Тогда в зависимости от окончания в слове “апатит” можно определить род.
Слово “апатит” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “апатит” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “апатит” находится по ссылке