Для определения рода слова “атолл” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “атолл” . Тогда в зависимости от окончания в слове “атолл” можно определить род.
Слово “атолл” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “атолл” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “атолл” находится по ссылке