Для определения рода слова “бактерия” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “бактерия” . Тогда в зависимости от окончания в слове “бактерия” можно определить род.
Слово “бактерия” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “бактерия” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “бактерия” находится по ссылке