Для определения рода слова “боеголовка” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “боеголовка” . Тогда в зависимости от окончания в слове “боеголовка” можно определить род.
Слово “боеголовка” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “боеголовка” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “боеголовка” находится по ссылке