Для определения рода слова “вариация” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “вариация” . Тогда в зависимости от окончания в слове “вариация” можно определить род.
Слово “вариация” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “вариация” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “вариация” находится по ссылке