Для определения рода слова “водоворот” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “водоворот” . Тогда в зависимости от окончания в слове “водоворот” можно определить род.
Слово “водоворот” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “водоворот” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “водоворот” находится по ссылке