Для определения рода слова “жемчужинка” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “жемчужинка” . Тогда в зависимости от окончания в слове “жемчужинка” можно определить род.
Слово “жемчужинка” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “жемчужинка” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “жемчужинка” находится по ссылке