Для определения рода слова “йота” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “йота” . Тогда в зависимости от окончания в слове “йота” можно определить род.
Слово “йота” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “йота” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “йота” находится по ссылке