Для определения рода слова “катер” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “катер” . Тогда в зависимости от окончания в слове “катер” можно определить род.
Слово “катер” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “катер” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “катер” находится по ссылке