Для определения рода слова “комендатура” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “комендатура” . Тогда в зависимости от окончания в слове “комендатура” можно определить род.
Слово “комендатура” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “комендатура” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “комендатура” находится по ссылке