Для определения рода слова “комиссариат” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “комиссариат” . Тогда в зависимости от окончания в слове “комиссариат” можно определить род.
Слово “комиссариат” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “комиссариат” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “комиссариат” находится по ссылке