Для определения рода слова “крупинка” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “крупинка” . Тогда в зависимости от окончания в слове “крупинка” можно определить род.
Слово “крупинка” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “крупинка” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “крупинка” находится по ссылке