Для определения рода слова “кхмер” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “кхмер” . Тогда в зависимости от окончания в слове “кхмер” можно определить род.
Слово “кхмер” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “кхмер” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “кхмер” находится по ссылке