Для определения рода слова “марафонец” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “марафонец” . Тогда в зависимости от окончания в слове “марафонец” можно определить род.
Слово “марафонец” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “марафонец” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “марафонец” находится по ссылке