Для определения рода слова “методология” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “методология” . Тогда в зависимости от окончания в слове “методология” можно определить род.
Слово “методология” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “методология” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “методология” находится по ссылке