Для определения рода слова “низовье” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “низовье” . Тогда в зависимости от окончания в слове “низовье” можно определить род.
Слово “низовье” употребляется в среднем роде (Потому как в начальной форме слова “низовье” окончание [е], [о]).Полный морфологический разбор Cуществительного “низовье” находится по ссылке