Для определения рода слова “онтология” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “онтология” . Тогда в зависимости от окончания в слове “онтология” можно определить род.
Слово “онтология” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “онтология” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “онтология” находится по ссылке