Для определения рода слова “пеня” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “пеня” . Тогда в зависимости от окончания в слове “пеня” можно определить род.
Слово “пеня” употребляется в женском роде (Потому как в начальной форме слова “пеня” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “пеня” находится по ссылке