Для определения рода слова “пепсин” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “пепсин” . Тогда в зависимости от окончания в слове “пепсин” можно определить род.
Слово “пепсин” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “пепсин” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “пепсин” находится по ссылке