Для определения рода слова “перешеек” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “перешеек” . Тогда в зависимости от окончания в слове “перешеек” можно определить род.
Слово “перешеек” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “перешеек” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “перешеек” находится по ссылке