Для определения рода слова “подоконник” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “подоконник” . Тогда в зависимости от окончания в слове “подоконник” можно определить род.
Слово “подоконник” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “подоконник” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “подоконник” находится по ссылке