Для определения рода слова “префикс” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “префикс” . Тогда в зависимости от окончания в слове “префикс” можно определить род.
Слово “префикс” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “префикс” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “префикс” находится по ссылке