Для определения рода слова “пюпитр” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “пюпитр” . Тогда в зависимости от окончания в слове “пюпитр” можно определить род.
Слово “пюпитр” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “пюпитр” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “пюпитр” находится по ссылке