Для определения рода слова “семечко” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “семечко” . Тогда в зависимости от окончания в слове “семечко” можно определить род.
Слово “семечко” употребляется в среднем роде (Потому как в начальной форме слова “семечко” окончание [е], [о]).Полный морфологический разбор Cуществительного “семечко” находится по ссылке