Для определения рода слова “столоначальник” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “столоначальник” . Тогда в зависимости от окончания в слове “столоначальник” можно определить род.
Слово “столоначальник” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “столоначальник” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “столоначальник” находится по ссылке