Для определения рода слова “хорунжий” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “хорунжий” . Тогда в зависимости от окончания в слове “хорунжий” можно определить род.
Слово “хорунжий” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “хорунжий” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “хорунжий” находится по ссылке