Для определения рода слова “чудодей” его необходимо поставить в именительный падеж единственного числа, получается форма: “чудодей” . Тогда в зависимости от окончания в слове “чудодей” можно определить род.
Слово “чудодей” употребляется в мужском роде (Потому как в начальной форме слова “чудодей” окончание [а], [я] или [ ] нулевое).Полный морфологический разбор Cуществительного “чудодей” находится по ссылке